Glykolýza
Energie pro svalovou kontrakci pochází z ATP (adenosintrifosfát). ATP se tvoří aerobním (na kyslíku závislým) dýcháním v mitochondriích svalových buněk s využitím energie uvolněné glykolýzou. Rozbití vysokoenergetické vazby v ATP uvolňuje ADP (adenosindifosfát), anorganický fosfát (Pi) a jeden proton nebo vodíkový ion (Hþ). Protony jsou využívány mitochondriemi.
Poslední krok glykolýzy poskytuje dvě molekuly pyruvátu spolu s protony ze štěpení ATP. Za podmínek dostatku kyslíku je pyruvát dále metabolizován v mitochondriích; avšak za podmínek nedostatečné dostupnosti kyslíku, jak je to běžné při intenzivní zátěži, se laktát (kyselina mléčná) hromadí ve svalech.
Až donedávna se předpokládalo, že toto nahromadění kyseliny mléčné způsobuje acidózu, charakterizovanou svalovou bolestí a únavou, ale nyní se uznává, že acidóza nebo spalování svalů je výsledkem uvolnění více protonů, než mohou mitochondrie využít. Pyruvát absorbuje protony za vzniku laktátu, dočasně zpomaluje rozvoj acidózy a svalové únavy.
Laktát je metabolizován během 15–30 minut po cvičení. Svalové buňky také ukládají energii ve fosfátových vazbách ve sloučeninách, jako je fosfokreatin, který je známý jako fosfagenový systém. Uvolňování fosfátu z těchto sloučenin za účelem poskytnutí energie také produkuje protony, které přispívají k acidóze.